Хосе Мария Серт родился в Барселоне в 1874 году, в семье богатых промышленников.

Он обучался в институте иезуитов, Барселонской Школе искусств и ремесел (Llotja), занимался в разных личных академиях живописи.

В 1899 переехал в Париж, где вступил в контакт с группой Наби.

Был женат два раза — на Мизии Годебской, музе символистов, и Русудане Мдивани. Он был дядей архитектором Хосе Луиса Серта. Погиб в Барселоне в 1945 году, похоронен у собора в городке Вик, который украшен его фресками.