Первыми учителями были отец живописец Лукаш Смуглевич (кроме Франциска, ещё четыре его отпрыска связаны с изобразительным искусством) и родственник Шимон Чехович. В 1763—1764 годах обучался в Риме у Антона фон Марона, с 1765 года как стипендиат короля Станислава Августа в римской Академии святого Луки. В 1784 году возвратился в Варшаву. В 1785 году и, после перерыва, с 1797 года жил и работал в Вильне, в 1786—1797 годах в Варшаве, где основал личную школу живописи.
Основал кафедру живописи и рисунка в Главной виленской школе, в 1803 году перевоплощенной в императорский Виленский институт, и управлял ею; доктор (1797). В 1800—1801 годах жил и работал в Санкт-Петербурге, а именно оформлял интерьеры Михайловского замка.
Был похоронен на кладбище Росса (Расу) в Вильне. Но четкое место его захоронения было непонятно уже в конце XIX века.
Творчество
Троцкие воротаЖивопись по собственному нраву классицистическая (в большей степени картины на темы старой истории и Библии, портреты; бытовые сцены), с элементами барокко. Писал картины для костёлов Варшавы и других городов Польши. В вильнюсском костёле Святых Петра и Павла находится одно из полотен Смуглевича на религиозную тему — «Прощание св. Петра и Павла» (1804).
Создатель цикла акварелей с видами строительных памятников Вильны (1785; Художественный музей Литвы), имеющих значение источника ценной иконографической инфы об исчезнувших либо необратимо изменившихся сооружениях. Благодаря бессчетным репродукциям обширно известны акварели Смуглевича, зафиксировавшие ворота виленской городской стенки и развалины царского замка в Вильне.
В 1802 году вкупе с братом Антонием Смуглевичем украшал зал заседаний в Главной виленской школе, сейчас Зал Смуглявичюса Вильнюсского института (читальный зал редчайшей книжки библиотеки Вильнюсского института).
Творчество оказало огромное воздействие на развитие литовского изобразительного искусства.
Литовские фермеры
Персидские послы у короля Эфиопии. Ок. 1785 (Художественный музей Литвы, Вильнюс).
Скифские послы у Дария. Ок. 1785 (Художественный музей Литвы, Вильнюс).
Портрет семьи Прозор. 1789 (Государственный музей, Варшава).
Присяга Тадеуша Костюшко на краковском рынке. 1797 (Государственный музей, Познань).
Эстер перед Артаксерксом. 1778